幾乎所有的陶氏RO膜系統在停機保存前都應進行一次化學清洗，當了解到膜元件已經存在污染時，先清洗后保存就更為重要。并且在清洗殺菌后還要將膜系統中充滿保護液。以下為陶氏RO膜系統在停機保存前的操作步驟。
典型的陶氏RO膜化學清洗步驟如下：
以pH＝11的溫和堿性清洗液清洗2小時，然后進行殺菌和短時酸洗。如果原水中不含結垢和金屬氫氧化物成份，可以不進行酸性清洗，具體請參閱《陶氏反滲透膜系統的石灰軟化措施簡介》。
清洗和殺菌之后，按如下步驟在10小時之內進行保存：
1) 趕走壓力容器內的空氣，將陶氏RO膜元件完全浸泡在1~1.5%(wt)亞硫酸氫鈉保護溶液中。為使系統內的殘留空氣最少，應采用循環溢流方式循環亞硫酸氫鈉保護液，使最高壓力容器開口處產生亞硫酸氫鈉保護液的溢流。
2) 關閉所有閥門，使陶氏RO膜系統隔絕空氣。否則，空氣將會氧化亞硫酸氫鈉使保護液失效。
3) 每周檢查一次保護液的PH值，當pH低于3時，更換保護液；
4) 至少每月更換一次保護液。
在停機保護期間，RO反滲透膜系統須處于不結冰狀態，系統環境溫度不得超過45℃（113℉）。低溫條件有利于停機保護。
