陶氏反滲透膜不是萬能的，有以下4點做不到。
1、全量過濾
普通過濾通常為物料完全垂直通過過濾介質達成過濾，當使用陶氏反滲透膜時，不允許有機物或鹽分透過膜，如果采用全量過濾將導致膜的表面因這些物質的富集而產生堵塞和污染。為防止在陶氏反滲透膜表面污染物的累積，在進水流道側引入沖刷流動方式，這種過濾方式稱為錯流過濾，反滲透系統總是將進水分成兩股水流，即被膜所截留的含濃縮溶質的濃縮液和透過膜面得到凈化的透過液。
2、極限濃度
自然滲透過程中，水分子會從純水側透過半透膜遷移到高濃度的溶質側以平衡溶液的強度。針對陶氏反滲透膜而言，最后平衡點水壓稱為該溶液的滲透壓。溶液的滲透壓取決于溶質的種類和濃度，隨著進水不斷被濃縮，就需要克服更高的溶液滲透壓，這樣也就需要施加更高的進水壓力迫使水分子透過陶氏反滲透膜，由于膜面上的壓力和溶質溶解度的極限之故，每一種溶液具有比較大的實際允許運行濃度。
3、過量的懸浮物質
高懸浮物（不溶物）含量的進料將迅速污染陶氏反滲透膜，需設置合適的預處理以優化這類進料的預處理過程。這時在反滲透膜前通常要設置超濾或微濾。
4、絕對分離
雖然陶氏反滲透膜是非常精細的液體過濾過程并能分離很小的溶質，但仍不能制造出理想和完美的反滲透膜，溶質脫除率取決于膜材料等，雖然可以實現99.99%脫鹽率，但是要達到100％的分離要求是不現實的。
